Contrôle interne des PME à Genève en 2025 : piloter les risques et automatiser efficacement

La gestion des risques, la conformité réglementaire et l’optimisation des processus constituent des enjeux stratégiques pour les PME genevoises. Pourtant, le contrôle interne (SCI) reste une thématique trop peu investie en dehors des grandes entreprises ou des groupes cotés. Comment les PME peuvent-elles relever ce défi, limiter exposi­tion aux risques et tirer avantage des innovations technologiques pour structurer, sécuriser et simplifier la gestion interne ?

Ce guide apporte une vision pragmatique de la mise en place et de l’évolution du contrôle interne en PME, avec l’apport des outils modernes et une attention constante à la conformité, à la responsabilisation des équipes et à l’efficacité.

1. Pourquoi investir dans le contrôle interne ?

Le contrôle interne vise à donner une assurance raisonnable pour :

• La réalisation des objectifs opérationnels (fiabilité des informations, optimisation des flux, prévention des erreurs et fraudes),
• Le respect des lois et réglementations (fiscales, sociales, commerciales, protection des données),
• La sauvegarde des actifs et la continuité d’activité.

Cas concret : Un défaut de séparation des tâches dans la validation des factures fournisseurs peut conduire à des paiements non autorisés ou à des détournements, dont les impacts financiers et réputationnels sont parfois majeurs pour une PME.

2. Quelles sont les obligations légales en Suisse ?

Depuis la réforme du droit de la société anonyme, toutes les SA et Sàrl suisses doivent disposer d’une organisation appropriée du contrôle interne liée à leur taille et à leurs risques (art. 716a CO, art. 961 CO). Ce cadre, parfois perçu comme abstrait, ouvre cependant de réelles marges de manœuvre pour adapter le dispositif SCI à la réalité des PME.

Points-clés réglementaires :

• Depuis janvier 2023, les exigences sur le contrôle interne sont renforcées pour les entreprises d’intérêt public (mais les PME sont aussi concernées via les art. 716a et 961 CO).
• Obligation d’un rapport succinct sur l’organisation interne et les risques majeurs lors des AG (art. 961 CO).

Lien utile : Contrôle interne selon CO, Guide pratique

3. Cartographier et hiérarchiser les risques en PME

Avant toute démarche, identifier les principaux risques (erreurs comptables, paiements non autorisés, non-conformité fiscale, confidentialité mal gérée…) est essentiel.

Étapes concrètes :

1. Listez vos processus sensibles : facturation, paiements, paie, stocks, gestion des données, trésorerie, relations bancaires…
2. Analysez les risques potentiels sur chacun : qui est responsable, quelles séparations de tâches, quels contrôles, quels outils existent ?
3. Priorisez : concentrez vos efforts sur les processus clés où le risque est le plus élevé.

4. Construire un système de contrôle interne adapté et agile

Un dispositif SCI pertinent repose sur quelques principes simples, adaptés à la taille et aux ressources de la PME :

• Séparation des tâches : éviter qu’une seule personne réalise l’ensemble des opérations (ex. création du fournisseur, validation, paiement)
• Validation à plusieurs niveaux : introduire des étapes de vérification ou autorisation
• Traçabilité : stockage des preuves, journalisation des validations et accès aux documents clés
• Formation et sensibilisation : impliquer l’ensemble des collaborateurs, actualiser les procédures après chaque changement règlementaire ou technique.

Astuce : Documenter à l’aide de tableaux simples ou de schémas les circuits de validation essentiels, accessibles à tous.

5. Automatiser les contrôles : opportunités et limites

Les solutions de digitalisation (ex : Odoo, intégration ERP, logiciels de paie comme Swissdec) permettent de renforcer la cohérence des processus, d’intégrer des contrôles natifs et de gagner un temps précieux sur les tâches répétitives.

Exemples d’automatisation :

• Validation automatisée des factures : seuils définis, workflow de signature, alertes en cas de dépassement
• Reporting automatique : génération de rapports de TVA ou d’indicateurs de conformité
• Archiving électronique : garanties sur la traçabilité et l’intégrité documentaire

Toutefois, l’automatisation ne supprime pas la nécessité de contrôles humains ciblés : la vigilance reste de mise sur les exceptions, les nouveaux risques liés à la fraude cyber/systèmes et les évolutions réglementaires.

Lien utile : Automatisation et contrôle interne, insights PME

6. Exemples de bonnes pratiques et solutions concrètes en PME genevoise

• Nomination d’un responsable SCI : même si ce n’est pas à plein temps, identifiez une personne ressource pour coordonner et actualiser la cartographie des risques et la documentation des processus.
• Audit annuel interne ou externe : sollicitez un audit régulier (interne ou externalisé) pour une revue indépendante (points forts et axes d’amélioration).
• Tableaux de bord de suivi : mettez en place des KPIs (nombre d’anomalies, délai de validation, conformité des process) pour piloter l’efficacité de votre dispositif.
• Soutien d’un partenaire fiduciaire : l’accompagnement par une fiduciaire spécialisée facilite la mise en place, apporte ressources et regard externe pour sécuriser la conformité et libérer du temps opérationnel.

7. Points de vigilance et erreurs courantes

• SCI trop complexe ou théorique : privilégiez la simplicité et l’opérationnel, documentez ce qui est réellement appliqué, pas ce qui « devrait l’être ».
• Mise à jour insuffisante : les modifications de processus ou la croissance de l’entreprise nécessitent une revue systématique.
• Automatisation non suivie : tout automatisme doit rester sous contrôle et faire l’objet de contrôles-pilotes réguliers.

8. Outils utiles et ressources spécialisées

• Portail PME – Organisation du contrôle interne (Confédération)
• ExpertSuisee – Outils d’automatisation et SCI en PME (association suisse des experts du chiffre)

9. Conclusion : vers une efficacité accrue et une sécurité durable

Le contrôle interne concerne toutes les PME, quelle que soit leur taille. Il s’agit autant d’une démarche de conformité que d’une opportunité pour fiabiliser l’information, renforcer la confiance des partenaires, limiter les pertes et gagner en sérénité. Avec l’appui d’expériences professionnelles, le soutien d’outils numériques adaptés et d’un partenaire fiduciaire impliqué, la démarche se renforce et devient source de valeur ajoutée à la gestion de l’entreprise.

Besoin d’un diagnostic personnalisé ou d’une implémentation adaptée ? L’équipe d’Ark Fiduciaire accompagne les PME romandes à chaque étape pour allier conformité, efficacité et sécurité sur le pilotage interne.